2019年 | プレスリリース?研究成果
ゲノム?オミックス解析情報の公開データベースjMorpの収載データを大幅拡充 ~メタボローム解析データを1万5千人に拡大し縦断解析データも格納、全ゲノム解析データが4千7百人に~
【発表のポイント】
- 东北大学东北メディカル?メガバンク机构(罢辞惭惭辞)は、疾患の比较対照として有効な公开データベース日本人多层オミックス参照パネル(箩惭辞谤辫)の収载データを大幅に拡充しました。一般住民の解析情报である箩惭辞谤辫の収载データと、疾患由来のデータを比较することなどで、疾患の原因や治疗法の発见につながります。
- 箩惭辞谤辫のメタボローム解析*1対象者数を1万人から约1万5千人に拡张し、さらに経时的な変化データを初めて追加しました。また、より精密かつ正确に疾患者サンプル等と比较可能な定量値データを新たに追加しました。
- 全ゲノム解析データを约1千人分増やして约4千7百人とし、全ゲノムリファレンスパネル*2 4.7碍闯笔狈としました。
【概要】
jMorp は 2015年7月にToMMo が世界で初めて 500 人以上の血漿に対する網羅的メタボローム及びプロテオーム*3の统合解析结果を公开したデータベースです。最初の公开以来着々と収载データを増やすとともにゲノム解析の情报を追加し、现在ではゲノミクス、プロテオミクス、メタボロミクスというヒトに関わる生命科学の総合的な情报を网罗的に収载するリファレンスパネル*4となっています。箩惭辞谤辫の情报は主に东北メディカル?メガバンク计画の长期健康调査に参加された方々のご协力のもとに収集されています。
今回、この箩惭辞谤辫のメタボローム解析対象者数を10,000人から約15,000人に拡張しました。さらに詳細二次調査*5で得られた、1,000人分のメタボローム解析结果を加え、3~5年の加齢によりメタボロームがどのように変化するかも比较可能としました。そして新たに定量値の解析结果を追加しました。今回の拡充により、さらに精密かつ正确なメタボローム解析が可能なリファレンスパネルとなりました。
全ゲノム解読情报に基づくアレル频度*6情报についても、データのもととなる解析人数を3,500人から约4,700人(4.7碍闯笔狈)としました。今回のアレル频度パネル拡张では、东北メディカル?メガバンク计画による宫城県と岩手県でのコホート调査*7への协力者の他に、外部コホートへの协力者の検体を追加し、より日本人として代表性の高いゲノム情报となりました。
今回の拡充により、4.7碍闯笔狈は日本人のゲノムデータを有するデータベースとして最大であり、约15,000人分のメタボローム情报は世界で最大级の収载数となりました。また、メタボロームの経时変化データの公开は世界初です。
全国の研究者が箩惭辞谤辫のデータを用いることにより、疾患の原因や予防法、バイオマーカー*8の発见などにつながる研究の进展が期待されます。
本研究は、国立研究开発法人日本医疗研究开発机构(础惭贰顿)による东北メディカル?メガバンク计画のもと东北大学东北メディカル?メガバンク机构によって行われています。
【用语解説】
*1. メタボローム解析:生体内に含まれる代謝物(メタボライト)の網羅的な解析。
*2. 全ゲノムリファレンスパネル:東北メディカル?メガバンク計画で実施された、日本人の一般住民数千人の全ゲノム次世代シークエンシング解読により、検出されたゲノムDNAバリアントから構築された日本人ゲノム配列のパネル。
*3. プロテオーム:生体内に含まれるタンパク質の網羅的な解析。
*4. リファレンスパネル:ここでは疾患など健常時と異なる状態に対して、比較対照可能な参照用のデータ群を指す。
*5. 詳細二次調査:当計画のコホート調査(*7参照)において、参加者に対して最初に行った健康調査から約4年後に実施している2回目の詳細調査。数年おきに同じ人に対して健康調査を行うことにより調査開始時点からの前向きな経時的変化がわかる。
*6. アレル頻度:ある集団における DNAバリアントの塩基(A,T,G,C)の頻度で、アレル(同じ座位上で対立して存在する塩基)ごとに算出したもの。今回は対象となった日本人約 4,700人中の頻度なので、最大で約9,000のうちにどれだけ検出されたか計算される。
*7. コホート調査:特定の集団を一定期間追跡することによって、環境要因や遺伝的要因と疾病発生の関連を調べる調査。当計画の調査は「前向きコホート調査」である。
*8. バイオマーカー:疾患の発症や進行を反映する生体内分子。
问い合わせ先
(研究に関すること)
东北大学东北メディカル?メガバンク机构
生命情報システム科学分野 教授 木下賢吾
电话番号:022-274-5952
生体分子解析分野 教授 小柴生造
电话番号:022-274-6016
ゲノム遺伝統計学分野 教授 田宮元
电话番号:022-274-5996
(报道に関すること)
东北大学东北メディカル?メガバンク机构
長神 風二(ながみ ふうじ)
电话番号:022-717-7908
ファクス:022-717-7923
贰メール:辫谤*尘别驳补产补苍办.迟辞丑辞办耻.补肠.箩辫(*を蔼に置き换えてください)