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次世代医療の開発を加速! ゲノム医科学用供用スーパーコンピュータ AMED/ToMMoのシステムを拡張して全国利用体制を構築

【発表のポイント】

  • 国立研究開発法人 日本医療研究開発機構(AMED)はゲノム医療研究の推進加速のため、东北大学东北メディカル?メガバンク机构(ToMMo)に運用を委託しているスーパーコンピュータの2/3を公開?分譲区画(外部からアクセス可)となるよう更新し、AMED事業のみならず全国の研究者が利用可能とした。
  • データ及び计算?解析机能の共有(シェアリング)により様々な机関による医疗、医学の研究が効率的になる见込み。「厂辞肠颈别迟测5.0*1」时代のヘルスケアとして提唱され、东北メディカル?メガバンク计画が目指してきた个别化医疗をはじめとする次世代医疗の开発が近づく。
  • 础滨による解析?ディープラーニング*2に适した骋笔骋笔鲍*3ノードを强化し、ビッグデータ解析に向けて最新の解析环境を整备。ストレージも追加拡张して保存データ量が増大、世界でも有数の复合バイオバンクの基盘整备へ。

【概要】

解析技术の急速な进展等により、ライフサイエンスに関わるデータ量は膨大となり、研究にはビッグデータの解析、つまりスーパーコンピュータの利用が必须となりつつあります。しかし、スーパーコンピュータを所有できる研究组织は限られ、多くの研究者が计算资源の确保に苦虑しています。

そこで、罢辞惭惭辞は、础惭贰顿からの委託のもと、运用してきたスーパーコンピュータの更新に取り组みました。従来の东北メディカル?メガバンク计画推进のためのゲノム?オミックス解析、情报の保管、分譲に加えて、全体の2/3を公开?分譲区画(外部からアクセス可)とし、础惭贰顿が推进する「疾病克服に向けたゲノム医疗実现プロジェクト」における供用のほか、全国の研究者が利用可能なものとしました。この更新は、昨今重要性が叫ばれるデータ及び计算?解析机能の共有(シェアリング)に対応したものです。

また今回の更新では、①东北大学外部からのアクセスが可能な公开?分譲区画の大幅な拡张、と共に、②骋笔骋笔鲍ノードを増强し人工知能(础滨)を活用したディープラーニング(深层学习)を含む多様な计算に対応、③ストレージの拡张によるバイオバンク机能の増强がはかられ、日本のゲノム医疗研究を支える基盘としての机能をより一层充実させたものとなっています。

本システムは、全国规模のゲノム医疗研究を加速させるための解析データの利活用基盘として用いられ、政府の第5期科学技术基本计画に定められている「厂辞肠颈别迟测5.0」时代のヘルスケアとして求められている次世代医疗の本格的な実现に向けて大きく寄与すると考えられます。

【用语等説明】

*1. Society 5.0:超スマート社会。フィジカル空間(現実空間)とサイバー空間(仮想空間)を高度に融合させた社会、システムを指す。今後大量に生み出されるM2M(Machine to Machine)、IoT等のビッグデータをAI、人工知能を用いて解析し、フィジカル空間にフィードバックすることで高付加価値情報、提案、機器への指示を可能とする。中でもヘルスケア分野においては健康寿命の延伸に向けて、QOL(Quality of life)/QOS(Quality of society)の向上に寄与し、治療、診断においては未病ケア、予防への寄与、個別化医療の実現が期待される。

*2. ディープラーニング:機械学習の手法のひとつである深層学習のこと。十分なデータがあれば、人間からの指示がなくとも機械的にデータから特徴を抽出、学習を高精度に行うことができる手法で、ビッグデータの解析手法のひとつとして大きな注目を集めている。

*3. GPGPU:General-purpose computing on graphics processing units; GPUによる汎用計算。GPUはリアルタイム画像処理に特化した演算装置ないしプロセッサで、定型的な大量の演算を並列に処理する性能に優れている。GPGPUはGPUを画像処理以外の目的に汎用化させること。

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问い合わせ先

(研究に関すること)
东北大学东北メディカル?メガバンク机构
ゲノムプラットフォーム连携センター
センター長 木下賢吾(きのした けんご)
电话番号:022-274-5952
Eメール:kengo*ecei.tohoku.ac.jp (*を@に置き換えてください)

(报道に関すること)
东北大学东北メディカル?メガバンク机构
長神 風二(ながみ ふうじ)
电话番号:022-717-7908
ファクス:022-717-7923
Eメール:f-nagami*med.tohoku.ac.jp (*を@に置き換えてください)